Amuc_1100 : la protéine qui fait le travail

Il y a une énigme au cœur de la façon dont Akkermansia muciniphila est utilisée. La forme étudiée chez l'humain, et la forme autorisée en Europe, est pasteurisée : des cellules traitées par la chaleur, non vivantes. Comment des bactéries mortes peuvent-elles faire quoi que ce soit ? La réponse tient à une seule protéine au nom peu glorieux, Amuc_1100, et à l'endroit de la cellule où cette protéine se trouve.

Une protéine à la surface

Akkermansia est enveloppée d'une membrane externe, dans laquelle sont enchâssées des protéines tournées vers le monde extérieur : les parties de la bactérie qui touchent physiquement les cellules de votre muqueuse intestinale. Amuc_1100 est l'une de ces protéines de la membrane externe. La bactérie ne la sécrète pas et ne la fabrique pas à la demande ; c'est un élément structurel fixe de la surface cellulaire, présent que la cellule soit vivante ou non.

Ce dernier détail est la clé de tout ce qui suit. Une protéine de surface n'a pas besoin d'une cellule vivante et active pour faire son travail. Si ce travail consiste à entrer en contact avec la muqueuse intestinale et à déclencher une réponse, alors la condition est que la protéine soit présente et correctement conformée. Que la bactérie autour d'elle soit encore vivante est une autre question.

L'expérience de 2017

En 2017, Hubert Plovier et ses collègues ont cherché ce qui, précisément, dans Akkermansia, était responsable de ses effets métaboliques. En travaillant sur des souris obèses et diabétiques, ils ont mené le genre d'expérience nette et disséquante qui rend un mécanisme convaincant (Plovier et al., 2017).

Deux résultats se sont détachés. La bactérie pasteurisée a fonctionné au moins aussi bien que la vivante : tuer les cellules par la chaleur n'a pas aboli le bénéfice, et l'a par endroits amélioré. Et lorsque l'équipe a isolé Amuc_1100 et l'a administrée seule, sans aucune bactérie, juste la protéine purifiée, celle-ci a reproduit une grande partie de l'amélioration métabolique. Un composant unique, extrait entièrement de la cellule, portait une large part de l'effet dont l'organisme entier est crédité.

Le bénéfice s'était resserré de « cette bactérie » à « cette protéine à la surface de cette bactérie ».

Pourquoi cela résout le paradoxe du pasteurisé

Si le composant actif est une protéine structurelle thermostable située à la surface de la cellule, la pasteurisation ne vous coûte pas grand-chose. Elle laisse Amuc_1100 à la surface, intacte et capable d'entrer en contact, tout en supprimant l'imprévisibilité liée à l'administration d'un microbe vivant. L'histoire du paradoxe du pasteurisé est racontée en entier ailleurs ; Amuc_1100 en est la raison moléculaire.

Cela explique aussi pourquoi la conservation compte tant pour nous. Si la valeur réside dans une protéine de surface, tout l'enjeu du procédé est de garder cette protéine intacte et correctement repliée — ce que la lyophilisation douce sait faire. C'est le raisonnement derrière l'Akkermansia pasteurisée et lyophilisée de Vekovia · Myrtille.

La suite chez l'humain, et la limite honnête

Les travaux sur Amuc_1100 sont de la recherche sur la souris, et nous l'indiquons comme telle. Mais l'histoire ne s'est pas arrêtée chez la souris. Le premier essai humain, chez 32 adultes en surpoids et résistants à l'insuline, a trouvé la forme pasteurisée sûre et montrant les améliorations métaboliques les plus nettes parmi les groupes étudiés (Depommier et al., 2019). La prédiction du laboratoire a tenu une fois arrivée chez l'humain.

Cet essai était petit et exploratoire, le mécanisme propre à la protéine reste surtout dérivé de l'animal, et nous ne transformons rien de tout cela en allégation produit. Ce que cela nous donne, c'est une explication exceptionnellement bien retracée de pourquoi la forme pasteurisée est celle qui a été étudiée et autorisée.

Dans l'article suivant, nous suivons le versant fruit de la formule et la piste des polyphénols qui le relie à cette même bactérie.